La mejora de la competitividad de las industrias agrarias, pesqueras y alimentarias y gestionar el Registro de Industrias Agrarias y Alimentarias de la CAPV, en el que está integrado el Registro de Embotelladores y Envasadores de Vinos y Bebidas Alcohólicas; el Registro de Operadores de Producción Integrada de Euskadi, el Registro de Entidades de Control y Certificación de Productos Agrarios y Alimentario; el Registro de Productores Artesanales de la CAPV y el Censo de las Asociaciones Agrarias y Alimentarias.
Asesorar y financiar iniciativas sectoriales para la comercialización de productos agrarios y alimentarios. Promover y gestionar la participación del sector agrario, pesquero y alimentario vasco en ferias, exposiciones y misiones comerciales.
Apoyar el asociacionismo, profesionalidad y cooperación empresarial de la industria agraria, pesquera y alimentaria; vertebración del sector, incluidas las organizaciones interprofesionales agrarias, pesqueras y alimentarias Ordenación forestal y la investigación en seguridad alimentaria y producción y consumo de alimentos sostenibles. Establecimiento y control de denominaciones de origen y distintivos de calidad y garantía de los productos agropesqueros, controlando los Consejos Reguladores.